清理田园可以减少多种病害的病原菌，常作为生产中防治病害的第一步。清理田园在换茬期进行，一般包括两步，一是清除杂草及蔬菜残体等，一是棚室的消毒。
清理田园中清除杂草和蔬菜残体，可以明显减少病原物、抑制病害进一步传播。
1.清除杂草
杂草生命力强，繁殖迅速，会与蔬菜争夺水分、养料、光照等，影响蔬菜的生长。近年来，蹦蹦草，学名叫酢浆草，在棚室中发生较重，引起了菜农的重视。蹦蹦草植株矮小，既能根茎繁殖，又能种子传播繁殖，种子小，数量多，能弹射，清除较难，而且繁殖迅速，难以彻底清除，是菜农非常头痛的一种杂草。
杂草是病毒的重要寄主，多是病毒病传播的初侵染源。在棚室蔬菜的换茬期，病毒寄生在杂草上，待温室大棚室内蔬菜重新定植后，由蚜虫、粉虱等刺吸式害虫将病毒重新传给了蔬菜。多年生杂草，如茅草、酢浆草（蹦蹦草）、苣荬菜（野苦菜）、蓟（刺儿菜）、蒲公英等，是病毒越冬的主要场所。棚室内多见的蹦蹦草、野苦菜等，是病毒病发生的重要侵染源。因此，清除棚室内外的杂草对防治病毒病有重要意义。
2.清理植株残体
包括拔除蔬菜残株并清理落叶、残根等。在蔬菜采收后，将遗留在田间的植株残体全部清除，并集中处理，以减少棚室内的病原菌数量。土壤中的病原菌，多数是随病叶、病枝、病果、病根进入土壤的。如黄瓜霜霉病菌是以卵孢子的形式在土壤中度过换茬期，卵孢子在黄瓜病部死亡或环境不适宜的情况下在病部产生，若将病株拔除，卵孢子就没有进入土壤传给下一茬的机会；根结线虫是以虫卵或二龄幼虫在土壤中度过换茬期，根结线虫以主根上最多，将蔬菜根系挖出集中处理，可以大大减少土壤中的根结线虫数量；侵染根部的病害，如枯萎病、青枯病、根腐病等，与根结线虫相似，清除残根可以大大减少病原物数量。病原物是依赖于植物体生存的，将植物体清除，也就减少了病原物的数量。蔬菜残体、杂草等不能随意堆放于棚室周围，以防病原物再度传入棚室内。
清理田园的第二步是处理棚室，减少棚室各处附着的病原物。在清除棚室内的残体、杂草后，利用各种手段消毒，清除棚室内的病原物，如夏季歇茬期可以关闭通风口高温闷棚，也可以用溴甲烷或石灰氮处理土壤，或用百菌清烟剂熏棚等。这些手段各有优缺点，需要根据各棚室的情况选择适合的方法。高温闷棚简单易行，花费小，效果也较好；土壤处理效果好，但成本高；烟剂熏棚对棚室内物体有较好的消毒作用，但对土壤内病原物基本无效。菜农要学会按需要取舍。
